Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms