Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chsy1Q6ZQ11 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms