Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rad54bQ6PFE3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rad54bQ6PFE3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rad54bQ6PFE3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rad54bQ6PFE3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms