Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms