Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I4

Pcnp, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnpQ6P8I4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnpQ6P8I4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PcnpQ6P8I4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnpQ6P8I4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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