Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cpsf6Q6NVF9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms