Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms