Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Vamp1Q62442 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Vamp1Q62442 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Vamp1Q62442 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Vamp1Q62442 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Vamp1Q62442 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Vamp1Q62442 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Vamp1Q62442 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Vamp1Q62442 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Vamp1Q62442 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Vamp1Q62442 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Vamp1Q62442 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Vamp1Q62442 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Vamp1Q62442 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Vamp1Q62442 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Vamp1Q62442 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Vamp1Q62442 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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