Protein–RNA interactions for Protein: Q62312

Tgfbr2, TGF-beta receptor type-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr2Q62312 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr2Q62312 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms