Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sox19Q62249 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sox19Q62249 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sox19Q62249 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sox19Q62249 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox19Q62249 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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