Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Phox2aQ62066 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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