Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vps41Q5KU39 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps41Q5KU39 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps41Q5KU39 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms