Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZH2

Tsr3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr3Q5HZH2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr3Q5HZH2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms