Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim26Q3V460 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim26Q3V460 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms