Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prr7Q3V0I2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr7Q3V0I2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr7Q3V0I2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr7Q3V0I2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr7Q3V0I2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr7Q3V0I2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr7Q3V0I2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr7Q3V0I2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr7Q3V0I2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr7Q3V0I2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr7Q3V0I2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr7Q3V0I2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr7Q3V0I2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr7Q3V0I2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr7Q3V0I2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr7Q3V0I2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr7Q3V0I2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr7Q3V0I2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr7Q3V0I2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr7Q3V0I2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr7Q3V0I2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms