Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Garnl3Q3V0G7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms