Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim40Q3UWA4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms