Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScimpQ3UU41 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScimpQ3UU41 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScimpQ3UU41 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScimpQ3UU41 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScimpQ3UU41 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScimpQ3UU41 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScimpQ3UU41 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScimpQ3UU41 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScimpQ3UU41 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScimpQ3UU41 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScimpQ3UU41 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms