Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsponQ3UPR9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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