Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ceacam5Q3UKK2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms