Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGM2

Nek10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek10Q3UGM2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek10Q3UGM2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek10Q3UGM2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms