Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms