Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cnnm1Q0GA42 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnnm1Q0GA42 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnnm1Q0GA42 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnnm1Q0GA42 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnnm1Q0GA42 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnnm1Q0GA42 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnnm1Q0GA42 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnnm1Q0GA42 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnnm1Q0GA42 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnnm1Q0GA42 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnnm1Q0GA42 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnnm1Q0GA42 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnnm1Q0GA42 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnnm1Q0GA42 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnnm1Q0GA42 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnnm1Q0GA42 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnnm1Q0GA42 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnnm1Q0GA42 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnnm1Q0GA42 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnnm1Q0GA42 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cnnm1Q0GA42 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms