Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms