Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CluQ06890 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CluQ06890 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CluQ06890 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CluQ06890 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CluQ06890 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CluQ06890 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CluQ06890 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CluQ06890 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CluQ06890 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CluQ06890 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CluQ06890 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CluQ06890 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CluQ06890 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CluQ06890 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CluQ06890 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CluQ06890 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CluQ06890 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CluQ06890 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CluQ06890 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CluQ06890 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CluQ06890 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CluQ06890 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CluQ06890 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CluQ06890 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CluQ06890 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CluQ06890 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CluQ06890 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CluQ06890 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CluQ06890 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CluQ06890 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CluQ06890 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CluQ06890 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CluQ06890 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CluQ06890 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CluQ06890 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CluQ06890 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CluQ06890 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CluQ06890 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CluQ06890 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CluQ06890 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CluQ06890 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CluQ06890 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CluQ06890 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CluQ06890 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CluQ06890 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CluQ06890 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CluQ06890 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CluQ06890 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CluQ06890 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CluQ06890 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CluQ06890 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CluQ06890 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CluQ06890 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms