Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox4Q06831 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox4Q06831 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms