Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms