Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Htr1fQ02284 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms