Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Snai1Q02085 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Snai1Q02085 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Snai1Q02085 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snai1Q02085 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snai1Q02085 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snai1Q02085 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snai1Q02085 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snai1Q02085 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snai1Q02085 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snai1Q02085 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snai1Q02085 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Snai1Q02085 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Snai1Q02085 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Snai1Q02085 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snai1Q02085 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snai1Q02085 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snai1Q02085 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms