Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms