Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SmsP97355 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmsP97355 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmsP97355 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmsP97355 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmsP97355 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmsP97355 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmsP97355 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmsP97355 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmsP97355 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmsP97355 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmsP97355 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SmsP97355 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmsP97355 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmsP97355 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmsP97355 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmsP97355 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmsP97355 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmsP97355 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmsP97355 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmsP97355 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmsP97355 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmsP97355 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmsP97355 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmsP97355 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmsP97355 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmsP97355 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmsP97355 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmsP97355 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmsP97355 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmsP97355 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SmsP97355 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SmsP97355 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SmsP97355 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmsP97355 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmsP97355 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmsP97355 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SmsP97355 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmsP97355 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SmsP97355 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmsP97355 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmsP97355 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmsP97355 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmsP97355 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SmsP97355 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SmsP97355 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SmsP97355 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmsP97355 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmsP97355 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmsP97355 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmsP97355 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmsP97355 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmsP97355 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms