Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl21cP86793 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms