Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx1P81068 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx1P81068 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx1P81068 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx1P81068 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms