Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx3P81067 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx3P81067 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx3P81067 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx3P81067 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx3P81067 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx3P81067 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx3P81067 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx3P81067 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx3P81067 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx3P81067 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx3P81067 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx3P81067 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms