Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shox2P70390 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shox2P70390 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shox2P70390 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shox2P70390 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shox2P70390 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms