Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3eP70275 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema3eP70275 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema3eP70275 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms