Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba4aP68368 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms