Protein–RNA interactions for Protein: P63011

Rab3a, Ras-related protein Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3aP63011 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3aP63011 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms