Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms