Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samsn1P57725 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms