Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acod1P54987 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms