Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Faf1P54731 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Faf1P54731 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Faf1P54731 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Faf1P54731 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Faf1P54731 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Faf1P54731 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Faf1P54731 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Faf1P54731 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Faf1P54731 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Faf1P54731 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Faf1P54731 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Faf1P54731 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Faf1P54731 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Faf1P54731 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Faf1P54731 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms