Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PitpnbP53811 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PitpnbP53811 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PitpnbP53811 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PitpnbP53811 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PitpnbP53811 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PitpnbP53811 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PitpnbP53811 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PitpnbP53811 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PitpnbP53811 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms