Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms