Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax7P47239 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax7P47239 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax7P47239 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax7P47239 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms