Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NodalP43021 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NodalP43021 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NodalP43021 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NodalP43021 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NodalP43021 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NodalP43021 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NodalP43021 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NodalP43021 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NodalP43021 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NodalP43021 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NodalP43021 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NodalP43021 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NodalP43021 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NodalP43021 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NodalP43021 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NodalP43021 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NodalP43021 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NodalP43021 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NodalP43021 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NodalP43021 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NodalP43021 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NodalP43021 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NodalP43021 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NodalP43021 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NodalP43021 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NodalP43021 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NodalP43021 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NodalP43021 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NodalP43021 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NodalP43021 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NodalP43021 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NodalP43021 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NodalP43021 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NodalP43021 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NodalP43021 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NodalP43021 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NodalP43021 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NodalP43021 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NodalP43021 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NodalP43021 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NodalP43021 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NodalP43021 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NodalP43021 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NodalP43021 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NodalP43021 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NodalP43021 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NodalP43021 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NodalP43021 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NodalP43021 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NodalP43021 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NodalP43021 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NodalP43021 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NodalP43021 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NodalP43021 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NodalP43021 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NodalP43021 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NodalP43021 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NodalP43021 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NodalP43021 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NodalP43021 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms