Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elk1P41969 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elk1P41969 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elk1P41969 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk1P41969 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk1P41969 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk1P41969 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms