Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms