Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mmp9P41245 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mmp9P41245 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mmp9P41245 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mmp9P41245 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Mmp9P41245 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Mmp9P41245 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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