Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtlP38585 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TtlP38585 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TtlP38585 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TtlP38585 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TtlP38585 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TtlP38585 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TtlP38585 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TtlP38585 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TtlP38585 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TtlP38585 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TtlP38585 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TtlP38585 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TtlP38585 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TtlP38585 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TtlP38585 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TtlP38585 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TtlP38585 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TtlP38585 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TtlP38585 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TtlP38585 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtlP38585 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TtlP38585 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TtlP38585 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TtlP38585 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TtlP38585 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TtlP38585 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TtlP38585 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TtlP38585 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TtlP38585 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TtlP38585 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TtlP38585 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TtlP38585 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtlP38585 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtlP38585 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtlP38585 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtlP38585 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtlP38585 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtlP38585 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms